Analyses of the NAC Transcription Factor Gene Family in Gossypium raimondii Ulbr.： Chromosomal Location, Structure, Phylogeny, and Expression Patterns

Abstract

NAC 域蛋白质是知道在各种各样的植物起多样的作用的植物特定的抄写因素发展进程。在现在的学习，我们在 Gossypium raimondii Ulbr 执行了 NAC 基因家庭的第一全面研究，合并种系发生，介绍的 chromosomal 地点，基因结构，保存主题，和表示分析。我们识别了种系发生地被聚类进 18 个不同亚科的 145 NAC 抄写因素(NAC-TF ) 基因。这些， 127 NAC-TF 基因越过 13 个染色体被散布，(55%) 80 优先地被保留位于两个的副本复制了区域，六位于 triplicated chromosomal 区域。NAC-TF 基因的多数出现了时间 -- ，空间 -- ，并且织物特定的表示模式基于 transcriptomic 和 qRT-PCR 分析。然而，几副本基因的表示模式部分是冗余的，建议在他们的进化期间的 sub-functionalization 的出现。基于他们的 genomic 组织，我们结束了复制在 G 显著地贡献了到 NAC-TF 基因家庭的扩大的那 genomic。raimondii。他们的表示侧面的全面分析能在 G 在 NAC 基因家庭的成员之中提供新奇卓见进功能的分叉。raimondii。