Plankton community composition in the Three Gorges Reservoir Region revealed by PCR-DGGE and its relationships with environmental factors

Abstract

在一个水库生态系统探索在社区作文和环境之间的关系，从三个峡水库区域的浮游生物社区被采指纹的使中毒 PCR 坡度胶化电气泳动学习。细菌、真核细胞的运作的分类单位(OTU ) ，由放大 PCR 的 16S 和 18S rRNA 基因的 DGGE 分析产生了，为“主导的生物多样性单位”被用作代理人。在这些地点之中的 OTU 作文是异构的；46.7% 全部的细菌的 OTU (45 ) 和 64.1% 真核细胞的 OTU (39 ) 在采样地点的不到一半被识别。有 OTU 聚类的算术一般水准(UPGMA ) 的未加权的对组方法建议在 Xiangxi 的浮游生物社区撕开地点不与从长江地点的那些总是显著地不同，尽管有在他们的环境描述的清楚的差别。正规通讯分析(CCA ) 被使用进一步调查在 OTU 作文和环境因素之间的关系。开始的二把 CCA 分类斧子建议细菌的社区作文首先与NO_3~的变量被相关-- N ，溶解的氧()，并且真核细胞的社区主要是的SiO_3~(2-) -Si,whereas,the 与集中相关，PO_4~(3-) -P,and SiO_3~(2-) -Si 。