The Genome of Dendrobium officinale Illuminates the Biology of the Important Traditional Chinese Orchid Herb

Abstract

Dendrobium officinale Kimura et Migo 是有装饰价值和大量治疗学的效果的繁体中文兰花植物。这里，我们报导第一 de novo 由联合定序技术的第二代的 Illumina Hiseq 2000 和第三产生的 PacBio 为 D.officinale 装配了 1.35 个 Gb 染色体序列。我们发现兰花让完全的开花期基因设置了并且有一些特定的开花期基因。我们在与真菌共生和干旱抵抗有关的基因家庭观察了基因扩大。我们分析了 D.officinale 的药用的部件的生合成小径并且发现了 SPS 和 SuSy 基因的广泛的复制，它与多糖产生有关，并且 D.officinale 碱合成的小径能被扩大产生 16-epivellosimine。D.officinale 染色体集会表明一条新途径到译解大复杂染色体并且作为重要兰花种和繁体中文药， D.officinale 染色体将在药用的部件并且 dendrobe 的潜在的基因繁殖的兰花植物，以及学习的进化上便于未来研究。