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Comparative Analysis of JmjC Domain-containing Proteins Reveals the Potential Histone Demethylases in Arabidopsis and Rice

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2008

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Abstract

组蛋白甲基化动态平衡被控制在甲基化和 demethylation 之间的平衡维持染色质功能和发展规定完成。在动物,一个保存 Jumonji C (JmjC ) 领域在一个大组被发现嘘一 demethylases。然而,植物是否也包含 JmjC,仍然是不清楚的包含域活跃嘘一 demethylases。这里,我们在 dicot 植物, Arabidopsis,和单音的简易窄床植物米饭执行了染色体宽的屏幕和 JmjC 包含域的蛋白质的种系发生的分析,并且分别地发现 21 和 20 JmjC 包含域。我们也检验了 JmjC 包含域的蛋白质的表示并且为潜在的酶的活动把他们比作人的 JmjC 对应物。Arabidopsis JmjC 包含域的基因的空间表示模式表明他们都是活跃地抄录的基因。这些活跃植物 JmjC 包含域的基因能可能在 epigenetic 规定工作反对通常认为的集合的大数字的活动包含域嘘动态地调整的一项甲基转移酶活动嘘一甲基化动态平衡。