Design and application of 60mer oligonucleotide microarray in SARS coronavirus detection

Abstract

60mer oligonucleotide microarray 被设计并且适用于 SARS (严重急性呼吸症候群) 检测 coronavirus。三十 60mer 特定的 oligos 被设计盖住首先提交的 coronavirus 种类的整个染色体，根据 TOR2 的顺序(GENEBANK 同意：AY274119 ) 。这些教材与 2 看到的 12 脳 1 被综合并且打印进 microarray。RNA 从喉咙拖把和 SARS 病人的漱喉的液体被提取并且进双海滨 cDNAs 反向抄本。cDNAs 是由限制显示(RD ) 限制了 cDNA 碎片被准备技术并且用 Cy5 通用的教材由 PCR 标记。标记的样品然后为杂交被用于 oligo microarray。microarray 的诊断能力在洗并且扫描的步以后被评估。扫描结果证明 SARS 病人的样品是有 microarray 上的多重 SARS 探针的 hybridized，并且否定、空白的控制上没有信号。这些结果显示 SARS coronavirus 的染色体能被 60mer oligonucleotide microarray 在平行检测，它能改进诊断的积极比率。oligo microarray 能也被用于在疾病地位的不同阶段监视病毒基因的行为。