Construction of genetic maps for Citrus aurantium and C. latipes based on AFLP, RAPD and RFLP markers

Abstract

Introduction. Les agrumes ont, a l'echelle mondiale, une grande importance economique. Leur selection est longue du fait de la duree de leur periode juvenile, de leur heterozygotie et de l'embryonnie nucellaire. Les techniques de marquage moleculaire sont un outil important pour identifier les regions chromosomiques portant les loci des caracteres agronomiques importants et pour effectuer une selection, assistee par marqueurs, de porte- greffes d'agrumes. Ils ont donc ete utilises pour la construction de cartes de linkages pour #C. aurantium# and #C. latipes#. Materiel et methodes. L'evaluation du polymorphisme de 50 individus F1, issus d'un croisement entre #C. latipes# et C. aurantium, a ete faite a partir de l'etude par marqueurs AFLP (sept combinaisons d'amorces EcoRI/MseI), RADP (280 amorces) et RFLP (50 sondes isolees d'une bibliotheque genomique de PstI d'agrumes). Les marqueurs ont ete identifies en utilisant une strategie de pseudo-testcross et deux cartes de linkage l'une pour #C. latipes# l'autre pour #C. aurantium# ont ete construites en utilisant un logiciel adapte. Resultats et discussion. Pour C. latipes, 110 marqueurs de segregation (60 AFLP, 46 RAPD et 4 RFLP) ont ete identifies. Parmi eux, 92 ont forme 12 groupes de linkage (7 principaux et 5 mineurs) couvrant 600 cM, alors que 18 marqueurs sont restes non lies. Pour C. aurantium, 268 marqueurs de segregation (144 AFLP, 111 RAPD and 13 RFLP) ont ete identifies, dont 247 ont forme 20 groupes de linkage (10 majeurs et 10 mineurs) couvrant 1000cM, tandis que 21 marqueurs restaient non lies. L'etude d'un plus grand nombre d'individus apparait necessaire pour augmenter la fiabilite de la carte obtenue et entreprendre l'analyse des loci des caracteres quantitatifs (QTL).