Genomics of <i>Eucalyptus wood</i> traits

Abstract

A major focus of our research has been on using molecular technologies to guide breeding for high value wood and fibre traits in eucalypts. One approach has been to use genomic maps to locate and characterise QTL that control wood and fibre traits. A generic map for eucalypts has been developed that consists of codominant markers that can be assayed across the major commercial species. Also on the map are candidate genes for traits such as flowering and wood and fibre traits. QTL have been characterised for wood density, fibre length, pulp yield and microfibril angle. A number of these have been validated in a related pedigree. A subset of QTL colocates with candidate genes. Research is now focussed on DNA sequence variation in different parts of these candidate genes and determining if this variation is associated with variation in wood properties. Of particular interest are genes involved in fibre development and cell wall formation. A third approach is to profile the expression of genes in the tissue of interest and determine if this relates to variation in trait performance. Microarrays are being used to relate expression of several thousand genes in xylem tissue to variation in traits such as microfibril angle and density. eucalypt / linkage maps / QTL / candidate genes / xylem / microarrays Rsum -Gnomique des critres de qualit du bois d'eucalyptus. Notre recherche a t concentre sur l'utilisation de technologies molculaires pour guider l'amlioration gntique de critres importants de la qualit du bois et des fibres. On a dvelopp une carte gnrique pour les eucalyptus partir de marqueurs co-dominants intressant les principales espces d'intrt commercial. Figurent galement sur cette carte des gnes candidats concernant des caractres tels que la floraison et la qualit du bois et des fibres. On a mis en vidence des QTL pour la densit du bois, la longueur des fibres, le rendement en pte et l'angle des microfibrilles. Un certain nombre ont t valids sur des familles apparentes gnalogie connue. Un sous ensemble de QTL sont co-localiss avec des gnes candidats. On concentre maintenant les recherches sur la variabilit de squences ADN de ces gnes candidats pour savoir si elle est associe celle des critres de qualit du bois. Sont d'un intrt particulier les gnes impliqus dans le dveloppement des fibres et la formation des parois cellulaires. Une troisime approche consiste profiler l'expression des gnes dans les tissus en cause et rechercher s'il existe d'ventuelles relations avec la variabilit des caractres. On utilise des microrseaux pour relier l'expression de plusieurs milliers de gnes du xylme avec la variabilit de caractres tels que l'angle des microfibrilles et la densit du bois. eucalyptus / carte de liaison / QTL / gnes candidats / xylme / microrseaux