Family relationships and effective population size in a natural cohort of Atlantic cod (<I>Gadus morhua</I>) larvae

Abstract

Sibship relationships within a naturally spawned cohort of Atlantic cod ( Gadus morhua) larvae on the Western Bank of the Scotian Shelf were investigated by a likelihood ratio method that estimates relationships is among individuals using microsatellite (DNA fingerprint) information. We found no evidence of any temporal or spatial family structure among the larvae from seven different sample collections taken at sequential time intervals during a 21-d period of sampling the larval cohort. There was no evidence that larvae were more related within sample collections than across sample collections. Within each sample collection, there was no evidence of a family structure within or among the depths sampled. Similarly, there was no apparent change in the potential occurrence of sibship with time (successive sample collections), or in association with the passage of a storm during the sampling period. This cohort of cod larvae appears to have been a fairly homogeneous mixture of larvae that were not siblings and came from a large genetic pool. The minimum estimate of the inbreeding effective population size is 2800 individual spawners. Resume : Nous avons etudie la proximite genetique au sein d'une cohorte de larves de morue franche ( Gadus morhua) ecloses dans la nature sur le banc ouest de la plate-forme neo-ecossaise en utilisant une methode de rapport des vraisemblances qui permet d'estimer les liens entre individus a l'aide de donnees fournies par les microsatellites (identification par le code genetique). Nous n'avons pas trouve d'indication de structures familiales temporelles ou spatiales entre les larves de sept ensembles d'echantillons differents, preleves a des intervalles de temps sequentiels, au cours d'une periode de 21 d de prelevements dans la cohorte de larves. Il n'y avait pas d'indication que les larves etaient plus proches genetiquement au sein d'un meme ensemble d'echantillons que par comparaison aux larves des autres ensembles. A l'interieur de chaque ensemble d'echantillons, il n'y avait pas d'indication d'une structure familiale a une profondeur donnee ou entre les profondeurs de prelevement. De meme, aucun changement apparent dans la probabilite de proximite genetique n'a ete observe au fil du temps (prelevements successifs d'echantillons), ni par suite du passage d'une tempete au cours de la periode d'echantillonnage. Cette cohorte de larves de morue semble avoir ete constituee d'un melange assez homogene de larves qui n'etaient pas liees genetiquement, et qui provenaient d'un reservoir genetique important. La valeur estimative minimale du nombre d'individus requis dans une population pour que se manifeste la proximite genetique est de 2 800 geniteurs. (Traduit par la Redaction)